內尋靈性深度 外展事奉服務
衛理神學研究院的教育宗旨--
認識真理、裝備主僕、活出基督、培育使人作主門徒的工人。
衛理神學研究院的異象與使命--
衛理神學研究院是中華基督教衛理公會開辦的神學教育機構。神學院的異象是建立在上帝藉著耶穌基督道成肉身的啟示上，並且回應基督呼召使萬民成為門徒的大使命。因此，本院致力於塑造能回應現代情境的牧者及肯委身的門徒，一同投入教會服事的行列。我們的教育理念是透過傳統的轉化，使當代人看到福音的盼望，透過靈性紀律的操練，帶出有生命力的事奉，透過實踐中的反省，使信仰的群體成為社會正面轉化的力量。
衛理神學研究院的教育目標--
以培養現代牧職的神學教育，提供教會同工在實踐中的反省，並裝備門徒在教會與社會中的服事，來完成基督所吩咐的使命。
這是牧職與信徒同步提升的進深優質的神學教育，為了達到服務教會與社會，衛理神學研究院將致力成為教會忠實與負責的伙伴。衛理神學研究院在信望愛的基礎上，努力從事神學的探討，以期能促進身心靈、生存環境與社會的聖潔。另外，本院的價值也強調要回應上帝所創造的多元化的需求，藉著與不同宗派合作，促進普世教會的發展，以彰顯基督裡合而為一的信仰和上帝國臨到世界的精神。
衛理神學研究院提供的學位課程，包括：
衛理神學研究院致力於培養合於現代社會需求之基督徒領袖、同工及牧者為己任。本院的專任與兼任教師均為各領域的專業學者與牧者，具備豐富的牧會或專業實務經驗，對學生賦有強烈的使命感、熱誠與愛心。
認識真理、裝備主僕、活出基督、培育使人作主門徒的工人。
本校以聖經真理為根基，致力於引導學生認識真理、建立正確信仰與屬靈生命；藉著系統性的神學裝備與事奉訓練，基督生命為本，恩賜知識為輔，裝備忠心良善的主僕。同時強調在生活中實踐基督的教導，活出基督的生命樣式，見證福音的大能；並以培育能夠遵行大使命、帶領他人成為主門徒的工人為目標，裝備學員在教會與社會中發揮影響力，榮耀上帝。
在本會七十年的發展中，為了培養新一代的牧職與教會同工而於1999年成立了「台灣衛理神學研究院」（以下簡稱「衛神」）1998年的執行委員會除了通過神學院的章程辦法等必要的法規手續外，同時也聘請戴俊男博士（牧師）為神學院的第一任院長。1999年學校正式成立，初期開辦了教牧學博士、教牧諮商神學碩士、道學碩士、教牧諮商碩士、聖經碩士等學位課程同年也正式招生，第一學期共錄取四十三名學生，是為本院第一屆學生。
在戴院長的主持下，衛神在當時創立「諮商輔導」學程教育，除了相關的學位課程教學外，亦於2000年6月成立「衛理神學研究院附設衛理協談中心」（以下簡稱「協談中心」），將諮商教育與教牧工作的結合成為當時是本院在台灣的創舉，也受到各界的肯定。在此期間衛神亦獲得了亞洲神學協會（ATA）的認證。
2007年戴俊男院長屆齡退休，由吳仲徹博士（牧師）接任院長，吳院長除了接續著戴院長的實踐神學路線，將諮商教育更進一步落實並與教會的牧養工作，也繼續強化衛神的教牧養成訓練。
2009年吳院長因在長老教會的退休制度限制下，轉往了玉山神學院任教，本會有計畫地培養進修歸國的王春安博士（牧師）擔任第三屆院長。2011年王院長終因身體健康考量提早退休並舉家移民往加拿大，於是董事會決定由本會長牧及多年擔任神學院常務董事的龐君華牧師任代理院長一職至2014年6月。在這段期間內也正值本會在高雄福音新村土地的官司失利，財務面臨重大考驗，衛神一方面重新檢討探索前路，一方面也在這段期間內也獲得了東南亞神學研究院（ATESEA）的認證。
2014秋龐牧師後因健康狀況的原因請辭，董事會決定由神學院教務主任吳基仁博士（牧師）於同年7月接任代理院長，開始了一段神學院路線的探索過程，其後2016年劉幸枝牧師代理院長。
2017年董事會以訓練牧職為主要方向，暫時停招教牧輔導碩士，吳基仁牧師與劉幸枝牧師，先後離開衛神，於是董事會聘任了衛神校友，及第一位獲得衛神神學博士學位的林瑜琳博士擔任第四任院長，結束了衛神六年的代理院長時期。
2019年林博士請辭院長，於是董事會敦請了恩友堂牧會的長牧林烽銓牧師兼任代理院長，他除了繼續發展原先的本科的學位課程外，也積極的開展了推廣教育。
2022年，林牧師屆齡退休，董事會聘請魏連嶽博士擔任院長。魏院長上任後，恢復教牧輔導碩士學位課程，並籌建靈修學碩士課程。
2025年9月30日，魏院長聘期屆滿，董事會聘請林烽銓博士再次擔任代理院長至今。林院長上任後，恢復完整學制，以訓練牧職為主要方向，並調整及完善各項課程，以符合各神學協會對學程與辦學品質的要求。神學博士及靈修學碩士課程因師資不足，暫時停招。
衛理神學研究院為亞洲神學協會(ATA, Asia Theological Association)認證會員，獲得該學會認證之最高學位為博士學位。
2010年衛理神學研究院再次通過亞洲神學協會(ATA, Asia Theological Association)認證，
此協會於2010年加入美國大學註冊入學官員協會AACRAO，使認證學校都得到美國高等教育的認可。
衛理神學研究院通過認證學位如下：
衛神為ATA認證會員，獲得該學會認證之最高學位為博士學位。
該會正式來函原文摘錄如下：THE HIGHEST DEGREE LEVEL OF YOUR INSTITUTION ACCREDITED BY ATA: Doctorate。
2012年衛理神學研究院亦通過東南亞神學教育協會(ATESEA, The ASSOCIATION for THEOLOGICAL EDUCATION in South East Asia)認證評鑑。
戴俊男博士（牧師）1999-2007
吳仲徹博士（牧師）2007-2009
王春安博士（牧師）2009-2011
龐君華牧師 代理2011-2014
吳基仁博士（牧師）代理2014-2016.1
龐君華牧師 代理2016.2-2016.7
劉幸枝博士（牧師）代理2016-2017
林瑜琳博士 2017-2019
林烽銓博士（牧師）代理2019-2022
魏連嶽博士 2022-2025.9
林烽銓博士（牧師）2025-迄今
華神教牧博士、道學碩士。曾任基督教導航會中壢地區代表、衛理公會城中教會、雅各堂、恩友堂主任牧師、中國主日學協會董事長、台灣教會合作協會監事、衛理神學研究院兼任代理院長。現為台灣讀經會講員團成員及研經釋義作者、救恩之聲講員團成員、衛理神學研究院代理院長。
衛神師生合影
感謝主帶領衛神走過20個年頭
衛神北衛班學生上課